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Enregistrement W2046506101 · doi:10.1242/jcs.00617

Lipid- and protein-mediated multimerization of PSD-95: implications for receptor clustering and assembly of synaptic protein networks

2003· article· en· W2046506101 sur OpenAlexafffund
Karen S. Christopherson, Neal Sweeney, Sarah E. Craven, Rujun Kang, Alaa El-Husseini, David S. Bredt

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCAmerican Heart AssociationHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésPalmitoylationMyristoylationBiologyPostsynaptic densityCysteineHEK 293 cellsSerineAmino acidC-terminusCell biologyExcitatory postsynaptic potentialBiochemistryBiophysicsPhosphorylationReceptorEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Postsynaptic density protein 95 (PSD-95/SAP-90) is a palmitoylated membrane-associated guanylate kinase that oligomerizes and clusters ion channels and associated signaling machinery at excitatory synapses in brain. However, the mechanism for PSD-95 oligomerization and its relationship to ion channel clustering remain uncertain. Here, we find that multimerization of PSD-95 is determined by only its first 13 amino acids, which also have a remarkable capacity to oligomerize heterologous proteins. Multimerization does not involve a covalent linkage but rather palmitoylation of two cysteine residues in the 13 amino acid motif. This lipid-mediated oligomerization is a specific property of the PSD-95 motif, because it is not observed with other palmitoylated domains. Clustering K+ channel Kv1.4 requires interaction of palmitoylated PSD-95 with tetrameric K+ channel subunits but, surprisingly, does not require multimerization of PSD-95. Finally, disrupting palmitoylation with 2-bromopalmitate disperses PSD-95/K+-channel clusters. These data suggest new models for K+ channel clustering by PSD-95 - a reversible process regulated by protein palmitoylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,352

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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