MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2046506681 · doi:10.1021/jp406883k

Dehydroergosterol as an Analogue for Cholesterol: Why It Mimics Cholesterol So Well—or Does It?

2014· article· en· W2046506681 sur OpenAlexafffund
Mohsen Pourmousa, Tomasz Róg, Risto Mikkeli, llpo Vattulainen, Lukasz M. Solanko, Daniel Wüstner, Nanna Holmgaard List, Jacob Kongsted, Mikko Karttunen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNovo Nordisk Fonden
Mots-clésMembraneChemistryMolecular dynamicsBiophysicsComputational chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although dehydroergosterol (DHE) is one of the most commonly used cholesterol (CHOL) reporters, it has remained unclear why it performs well compared with most other CHOL analogues and what its possible limitations are. We present a comprehensive study of the properties of DHE using a combination of time-resolved fluorescence spectroscopy, quantum-mechanical electronic structure computations, and classical atomistic molecular dynamics simulations. We first establish that DHE mimics CHOL behavior, as previous studies have suggested, and then move on to elucidate and discuss the particular properties that render DHE so superior. We found that the main reason why DHE mimics CHOL so well is due to its ability to stand upright in a membrane in a manner that is almost identical to that of CHOL. The minor difference in how DHE and CHOL tilt with respect to membrane normal has only faint effects on structural membrane properties, and even the lateral pressure profiles of model membranes with CHOL or DHE are almost identical. These results suggest that the mechanical/elastic effects of DHE on the function of mechanically sensitive membrane proteins are not substantially different from those of CHOL. Our study highlights similar dynamical behavior of CHOL and DHE, which implies that DHE can mimic CHOL in processes with free energies close to the thermal energy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,636

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Physical Chemistry BMême sujetLipid Membrane Structure and BehaviorTravaux en français237 207