Theoretical Study of the Oxidation Reaction and Electron Spin Resonance Parameters Involving Sulfite Oxidase
Notice bibliographique
Résumé
We present a density functional theory (DFT) study on the conversion of sulfite to sulfate with a model complex representing the active site of the molybdenum-containing enzyme sulfite oxidase (SO). This study considers the attack of the sulfur lone pair from SO(3)(2-) on the equatorial oxo ligand of the model complex as the initial step in the oxidation process. The good agreement between our energy profile and data derived from experimental kinetic parameters provides some support for the reaction mechanism of the oxidative half-reaction of SO proposed in this study. The enzymatic reductive half-reaction involves the formation of an Electron Spin Resonance (ESR) active Mo(V) species. Experimentally, differences in ESR parameters (g-values and (1)H hyperfine coupling constant) of the low- and high-pH forms of the enzyme have been found. The current study also presents DFT-based calculations on ESR parameters for three model complexes representing the paramagnetic center Mo(V) of SO in its possible low- and high-pH forms. We provide an analysis of the magnetic orbital coupling responsible for the calculated g-values. Finally, we suggest how the conformation and hydrogen bonding interactions of the hydroxyl ligand can explain the different ESR parameters at low- and high-pH.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».