Fipa cattle in the southwestern highlands of Tanzania: molecular characterization
Notice bibliographique
Résumé
This study aimed at characterising the genetic diversity of two Fipa cattle populations (Sumbawanga and Nkasi) of South-Western Tanzania, and establishing their genetic relationships with the other indigenous cattle strains (Tarime, Iringa red and Ankole) and Friesian cattle found in the area. The genetic diversity was analysed using 30 microsatellite markers. All the markers used were highly polymorphic. The Nkasi Fipa cattle exhibited the highest mean number of alleles (7.31) and mean genetic diversity (0.732) per locus, followed by Sumbawanga Fipa cattle with 7.10 mean number of alleles and 0.725 mean genetic diversity per locus, with the latter population having a very low mean inbreeding coefficient (FIS = 0.027). Three percent of the genetic diversity was due to differences among indigenous strains while the rest was due to differences among individuals within the strains. Small genetic distances (DA) were observed between Sumbawanga Fipa and Nkasi Fipa (0.032), Tarime (0.073), Iringa red (0.076) and Ankole cattle (0.086). As expected, the largest genetic distances were observed between the Friesian and all indigenous strains since this breed has a quite distinct genetic origin. In the assignment test, the proportion of animals from each group correctly assigned to their source population ranged from 55.3 percent (for Nkasi Fipa) to 100 percent (for Friesian). Despite the low genetic differentiation and genetic indistinctiveness of the Sumbawanga Fipa population from the other indigenous strains, its high genetic diversity, very low inbreeding coefficient and a threat emanating from population admixture with other indigenous strains underscore the importance of establishing appropriate conservation and management strategies for it.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».