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Enregistrement W2046662227 · doi:10.1097/pas.0b013e318293d83c

Identification of Succinate Dehydrogenase–deficient Bladder Paragangliomas

2013· article· en· W2046662227 sur OpenAlexaff
Emily F. Mason, Peter M. Sadow, Andrew J. Wagner, Stephen P. Remillard, Trevor A. Flood, Eric C. Bélanger, Jason L. Hornick, Justine A. Barletta

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdrenal and Paraganglionic Tumors
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSuccinate dehydrogenaseIdentification (biology)UrologyMedicinePathologyChemistryBiologyBiochemistryMitochondrion

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A significant number of patients with paragangliomas harbor germline mutations in one of the succinate dehydrogenase (SDH) genes (SDHA, B, C, or D). Tumors with mutations in SDH genes can be identified using immunohistochemistry. Loss of SDHB staining is seen in tumors with a mutation in any one of the SDH genes, whereas loss of both SDHB and SDHA expression is seen only in the context of an SDHA mutation. Identifying an SDH-deficient tumor can be prognostically significant, as tumors with SDHB mutations are more likely to pursue a malignant course. Although the rate of SDH deficiency in paragangliomas in general is known to be approximately 30%, there are only rare reports of SDH-deficient bladder paragangliomas. Therefore, the aim of this study was to determine the rate of SDH deficiency in bladder paragangliomas. Eleven cases of bladder paragangliomas were identified. Hematoxylin and eosin-stained slides of all tumors were reviewed, and immunohistochemical analysis for SDHB and SDHA was performed. For cases with loss of SDHA expression by immunohistochemistry, mutation analysis of the SDHA gene was performed. Loss of SDHB staining was seen in 3 (27%) cases (2 with loss of SDHB only, 1 with loss of SDHB and SDHA). Patients with SDH-deficient tumors were younger than those with tumors with intact SDH expression (mean age at presentation 39 y and 58 y, respectively). Of the 2 patients with SDHB-deficient and SDHA-intact tumors, one was found to have a germline SDHB mutation, and the other had a family history of a malignant paraganglioma. Both patients developed metastatic disease. The one patient with a tumor that was deficient for both SDHB and SDHA had no family history of paragangliomas and no evidence of metastatic disease. Sequencing of this tumor revealed a deleterious heterozygous single-base pair substitution in exon 10 of SDHA (c.1340 A>G; p.His447Arg) in both the tumor and normal tissue, indicative of a germline SDHA mutation, and a deleterious single-base pair substitution in exon 5 of SDHA (c.484 A>T; p.Arg162*) in 1 allele of the tumor only. No patients with intact SDH expression had a family history of paragangliomas; 1 had a synchronous paraganglioma, but none developed metastatic disease. A significant subset of bladder paragangliomas is SDH deficient. It is essential to identify SDH-deficient tumors, as the presence of an SDH mutation has prognostic implications and is important in guiding genetic counseling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,372
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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