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Enregistrement W2046705123 · doi:10.1016/j.taap.2007.02.004

Toxicogenomic evaluation of microcystin-LR treated with ultrasonic irradiation

2007· article· en· W2046705123 sur OpenAlexaff
Alice Hudder, Weihua Song, Kevin Ε. Ο'Shea, Patrick J. Walsh

Notice bibliographique

RevueToxicology and Applied Pharmacology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensOntario GenomicsUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health Sciences
Mots-clésMicrocystin-LRToxinMicrocystinBiologyLactate dehydrogenaseMolecular biologyGeneGene expressionCyanobacteriaBiochemistryEnzymeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microcystins are a family of toxins produced by cyanobacteria found throughout the world in marine and freshwater environments. The most commonly encountered form of microcystin is microcystin-LR (MC-LR). Humans are exposed to MC-LR by drinking contaminated water. The toxin accumulates rapidly in the liver where it exerts most of its damage. Treatment of water containing MC-LR by ultrasonic irradiation leads to the breakdown of the toxin. Both the parent toxin and the treated toxin reaction products (TTRP) were evaluated for toxic effects in mice. Animals were exposed to purified MC-LR or an equivalent dose of the TTRP and sacrificed after 4 h or 24 h. Serum was collected and assayed for lactate dehydrogenase (LDH) activity as an indicator of hepatotoxicity. LDH activity was detected in the serum of MC-LR exposed mice indicative of liver damage, but not in control mice. Only a fraction of that activity was detectable in mice exposed to TTRP. Liver RNA was used for microarray analysis and real-time PCR. Individual animals varied in their overall genomic response to the toxin; however, only 20 genes showed consistent changes in expression. These include chaperones which may be part of a generalized stress response; cytochrome P450 which may be involved in metabolizing the toxin; and lipid dystrophy genes such as lipin-2, uridine phosphorylase and a homolog to tribbles, a stress-inducible gene involved in cell death. Of the genes that responded to the MC-LR, none showed significant changes in expression profile in response to TTRP. Taken together, the data indicate that ultrasonic irradiation of MC-LR effectively reduces hepatotoxicity in mice and therefore may be a useful method for detoxification of drinking water.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,498
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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