Gene expression analysis of bovine blastocysts produced by parthenogenic activation or fertilisation
Notice bibliographique
Résumé
The processes underlying the very first moments of embryonic development are still not well characterised in mammals. To better define the kinetics of events taking place following fertilisation, it would be best to have perfect synchronisation of sperm entry. With fertilisation occurring during a time interval of 6 to 12h in the same group of fertilised oocytes, this causes a major variation in the time of activation of embryonic development. Bovine parthenogenesis could potentially result in better synchronisation and, if so, would offer a better model for studying developmental competence. In the present study, bovine oocytes were either parthenogenetically activated or fertilised and cultured in vitro for 7 days. Gene expression analysis for those two groups of embryos at early and expanded stages was performed with BlueChip, a customised 2000-cDNA array developed in our laboratory and enriched in clones from various stages of bovine embryo development. The microarray data analysis revealed that only a few genes were differentially expressed, showing the relative similarity between those two kinds of embryos. Nevertheless, the fact that we obtained a similar diversity of developmental stages with parthenotes suggests that synchronisation is more oocyte-specific than sperm entry-time related. We then analysed our data with Ingenuity pathway analysis. Networks of genes involved in blastocyst implantation but also previous stages of embryo development, like maternal-to-embryonic transition, were identified. This new information allows us to better understand the regulatory mechanisms of embryonic development associated with embryo status.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».