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Enregistrement W2046745157 · doi:10.1111/j.1600-6143.2007.01743.x

Indirect Recognition of T-Cell Epitopes Derived from the α3 and Transmembrane Domain of HLA-A2

2007· article· en· W2046745157 sur OpenAlexaff
Raj Hanvesakul, Bernard Maillère, David Briggs, Richard J. Baker, Mark Larché, Simon Ball

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Transplantation · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesKidney Research UK
Mots-clésEpitopeAllorecognitionELISPOTHuman leukocyte antigenImmunologyMajor histocompatibility complexAntigenImmune systemMedicineT cellBiologyComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Indirect allorecognition has been implicated in the mechanism of chronic rejection and alloantibody formation but precise definition of the epitopes involved has been limited. We have undertaken a detailed assessment of the antigenic properties of peptides derived from HLA-A2. Candidate epitopes were identified in vitro by assessment of MHC class II binding. The immune response to these epitopes was determined in patients awaiting a renal transplant by the assessment of PBMC activation using gamma-interferon ELISPOT. Twenty-two of fifty-five patients responded to peptides from HLA-A2 and this was associated with but not confined to those who had made antibody to HLA-A2 (14/18). Nineteen of twenty-two patients responded to peptides derived from the hypervariable alpha1 and alpha2 domains and 18/22 responded to peptides from the alpha 3 and transmembrane domain, the sequences of which show little polymorphism. In six patients, the sequence of these peptides was identical to self, that is, the response was autoimmune. The finding of indirect epitopes derived from regions of MHC class I that exhibit little polymorphism provides a novel perspective on the immune response to alloantigen and has potential implications for the development of specific therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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