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Enregistrement W2046767641 · doi:10.1073/pnas.0907189107

Ancient DNA analyses exclude humans as the driving force behind late Pleistocene musk ox ( <i>Ovibos moschatus</i> ) population dynamics

2010· article· en· W2046767641 sur OpenAlexaff
Paula F. Campos, Eske Willerslev, Andrei Sher, Ludovic Orlando, Erik Axelsson, Alexei Tikhonov, Kim Aaris‐Sørensen, Alex D. Greenwood, Ralf‐Dietrich Kahlke, П. А. Косинцев, Tatiana Krakhmalnaya, Т. В. Кузнецова, Philippe Lemey, R. D. E. MacPhee, Christopher A. Norris, Kieran Shepherd, Marc A. Suchard, Grant D. Zazula, Beth Shapiro, M. Thomas P. Gilbert

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensYukon Department of Tourism and CultureCanadian Museum of Nature
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesLundbeckfonden
Mots-clésMegafaunaPleistoceneHolocenePopulationAncient DNARange (aeronautics)EcologyBefore PresentExtinction (optical mineralogy)ArcticGenetic diversityClimate changeBiologyGeographyPaleontologyZoologyDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The causes of the late Pleistocene megafaunal extinctions are poorly understood. Different lines of evidence point to climate change, the arrival of humans, or a combination of these events as the trigger. Although many species went extinct, others, such as caribou and bison, survived to the present. The musk ox has an intermediate story: relatively abundant during the Pleistocene, it is now restricted to Greenland and the Arctic Archipelago. In this study, we use ancient DNA sequences, temporally unbiased summary statistics, and Bayesian analytical techniques to infer musk ox population dynamics throughout the late Pleistocene and Holocene. Our results reveal that musk ox genetic diversity was much higher during the Pleistocene than at present, and has undergone several expansions and contractions over the past 60,000 years. Northeast Siberia was of key importance, as it was the geographic origin of all samples studied and held a large diverse population until local extinction at approximately 45,000 radiocarbon years before present ((14)C YBP). Subsequently, musk ox genetic diversity reincreased at ca. 30,000 (14)C YBP, recontracted at ca. 18,000 (14)C YBP, and finally recovered in the middle Holocene. The arrival of humans into relevant areas of the musk ox range did not affect their mitochondrial diversity, and both musk ox and humans expanded into Greenland concomitantly. Thus, their population dynamics are better explained by a nonanthropogenic cause (for example, environmental change), a hypothesis supported by historic observations on the sensitivity of the species to both climatic warming and fluctuations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,541
Score d'incertitude au seuil0,334

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations241
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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