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Enregistrement W2046917802 · doi:10.1371/journal.pone.0061931

RASSF6 Expression in Adipocytes Is Down-Regulated by Interaction with Macrophages

2013· article· en· W2046917802 sur OpenAlexafffund
Yohei Sanada, Takahiro Kumoto, Haruna Suehiro, Fusanori Nishimura, Norihisa Katô, Yutaka Hata, Alexander Sorisky, Noriyuki Yanaka

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipokines, Inflammation, and Metabolic Diseases
Établissements canadiensUniversity of OttawaOttawa Hospital
Organismes subventionnairesMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésAdipose tissueAdipose tissue macrophagesAdipocyteWhite adipose tissueGene expressionInflammationBiologyIn vivoMacrophageInternal medicineEndocrinologyCell biologyChemistryGeneIn vitroImmunologyBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrophage infiltration into adipose tissue is associated with obesity and the crosstalk between adipocytes and infiltrated macrophages has been investigated as an important pathological phenomenon during adipose tissue inflammation. Here, we sought to identify adipocyte mRNAs that are regulated by interaction with infiltrated macrophages in vivo. An anti-inflammatory vitamin, vitamin B6, suppressed macrophage infiltration into white adipose tissue and altered mRNA expression. We identified >3500 genes whose expression is significantly altered during the development of obesity in db/db mice, and compared them to the adipose tissue mRNA expression profile of mice supplemented with vitamin B6. We identified PTX3 and MMP3 as candidate genes regulated by macrophage infiltration. PTX3 and MMP3 mRNA expression in 3T3-L1 adipocytes was up-regulated by activated RAW264.7 cells and these mRNA levels were positively correlated with macrophage number in adipose tissue in vivo. Next, we screened adipose genes down-regulated by the interaction with macrophages, and isolated RASSF6 (Ras association domain family 6). RASSF6 mRNA in adipocytes was decreased by culture medium conditioned by activated RAW264.7 cells, and RASSF6 mRNA level was negatively correlated with macrophage number in adipose tissue, suggesting that adipocyte RASSF6 mRNA expression is down-regulated by infiltrated macrophages in vivo. Finally, this study also showed that decreased RASSF6 expression up-regulates mRNA expression of several genes, such as CD44 and high mobility group protein HMGA2. These data provide novel insights into the biological significance of interactions between adipocytes and macrophages in adipose tissue during the development of obesity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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