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Enregistrement W2047301656 · doi:10.1172/jci37901

Girls homozygous for an IL-2–inducible T cell kinase mutation that leads to protein deficiency develop fatal EBV-associated lymphoproliferation

2009· article· en· W2047301656 sur OpenAlexfundno aff
Kirsten Huck, Oliver Feyen, Tim Niehues, Franz Rüschendorf, Norbert Hübner, Hans‐Jürgen Laws, Tanja Telieps, Stefan Knapp, Hans‐Heinrich Wacker, Alfons Meindl, Hassan Jumaa, Arndt Borkhardt

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKnut och Alice Wallenbergs StiftelseKarolinska InstitutetStiftelsen för Strategisk ForskningOntario Genomics InstituteOntario GenomicsGenome CanadaOntario Innovation TrustWellcome TrustGlaxoSmithKline
Mots-clésMutationImmunologyBiologyKinaseMedicineCancer researchVirologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fatal immune dysregulation that sometimes follows EBV infection in boys has been linked to mutations in two X chromosome-encoded genes, SLAM-associated protein (SAP) and X-linked inhibitor of apoptosis (XIAP). In this study we describe 2 girls from a consanguineous Turkish family who died after developing severe immune dysregulation and therapy-resistant EBV-positive B cell proliferation following EBV infection. SNP array-based genome-wide linkage analysis revealed IL-2-inducible T cell kinase (ITK) as a candidate gene for this immunodeficiency syndrome. Both girls harbored a homozygous missense mutation that led to substitution of a highly conserved residue (R335W) in the SH2 domain of ITK. Characteristics of ITK deficiency in mouse models, such as absence of NKT cells and high levels of eomesodermin in CD8+ cells, were seen in either one or both of the girls. Two lines of evidence suggested that R335W caused instability of the ITK protein. First, in silico modeling of the mutant protein predicted destabilization of the SH2 domain. Additionally, Western blot analysis revealed that, unlike wild-type ITK, the R335W mutant was nearly undetectable when expressed in 293 T cells. Our results suggest that ITK deficiency causes what we believe to be a novel immunodeficiency syndrome that leads to a fatal inadequate immune response to EBV. Because ITK deficiency resembles EBV-associated lymphoproliferative disorders in boys, we suggest that this molecular cause should be considered during diagnosis and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations290
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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