Identification of Free Radicals on Hemoglobin from its Self-peroxidation Using Mass Spectrometry and Immuno-spin Trapping
Notice bibliographique
Résumé
In an effort to understand the mechanism of radical formation on heme proteins, the formation of radicals on hemoglobin was initiated by reaction with hydrogen peroxide in the presence of the spin trap 5,5-dimethyl-1-pyrroline N-oxide (DMPO). The DMPO nitrone adducts were analyzed by mass spectrometry (MS) and immuno-spin trapping. The spin-trapped protein adducts were then subjected to tryptic digestion and MS analyses. When hemoglobin was reacted with hydrogen peroxide (H(2)O(2)) in the presence of DMPO, a DMPO nitrone adduct could be detected by immuno-spin trapping. To verify that DMPO adducts of the protein free radicals had been formed, the reaction mixtures were analyzed by flow injection electrospray ionization mass spectrometry (ESI/MS). The ESI mass spectrum of the hemoglobin/H(2)O(2)/DMPO sample shows one adduct each on both the alpha chain and the beta chain of hemoglobin which corresponds in mass to the addition of one DMPO molecule. The nature of the radicals formed on hemoglobin was explored using proteolysis techniques followed by liquid chromatography/mass spectrometry (LC/MS) and tandem mass spectrometry (MS/MS) analyses. The following sites of DMPO addition were identified on hemoglobin: Cys-93 of the beta chain, and Tyr-42, Tyr-24, and His-20 of the alpha chain. Because of the pi-pi interaction of Tyr-24 and His-20, the unpaired electron is apparently delocalized on both the tyrosine and histidine residue (pi-pi stacked pair radical).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».