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Enregistrement W2047515994 · doi:10.1002/dvdy.22462

A cascade of <i>irx1a</i> and <i>irx2a</i> controls <i>shh</i> expression during retinogenesis

2010· article· en· W2047515994 sur OpenAlexafffund
Siu Wah Choy, Chi Cheng, Sin Ting Lee, Vincent Li, Michelle Hui, Chi‐Chung Hui, Dong Liu, Shuk Han Cheng

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Dynamics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of ChinaCity University of Hong KongNational Science Foundation
Mots-clésBiologySonic hedgehogRetinaNeurogenesisZebrafishGene knockdownHedgehogCell biologyRetinalMorpholinoHedgehog signaling pathwayMuller gliaNeuroscienceGeneticsProgenitor cellSignal transductionGeneStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In animal retina, hedgehog expression drives waves of neurogenesis, but genetic programs that control its expression during retinal neurogenesis are poorly elucidated. We have previously reported that irx1a is required for propagation of the sonic hedgehog (shh) expression waves in developing zebrafish retina. Here, we found that irx2a is expressed in the developing retina and that knockdown of irx2a results in a retinal phenotype strikingly similar to that of irx1a morphants. The expression of irx2a in retina ganglion cells was shown to be irx1a- and ath5-dependent suggesting that irx1a and ath5 are transcriptional regulators of irx2a. Furthermore, irx2a expression could rescue impaired propagation of shh waves in irx1a morphants. Together, these observations suggest that Irx2 functions downstream of irx1a to control shh expression in the retina. We proposed a novel transcriptional cascade of ath5-irx1a-irx2a in the regulation of hedgehog waves during vertebrate retinal development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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