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Enregistrement W2047574342 · doi:10.1021/bi0480537

Identification of a Disulfide Switch in BsSco, a Member of the Sco Family of Cytochrome<i>c</i>Oxidase Assembly Proteins<sup>,</sup>

2005· article· en· W2047574342 sur OpenAlexaff
Qilu Ye, Iveta Imriskova-Sosova, Bruce C. Hill, Zongchao Jia

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesBrookhaven National Laboratory
Mots-clésCytochrome c oxidaseDisulfide bondChemistryFamily memberIdentification (biology)Oxidase testBiochemistryEnzymeBiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BsSco is a membrane-associated protein from Bacillus subtilis characterized by the sequence CXXXCP, which is conserved in yeast and human mitochondrial Sco proteins, and their bacterial homologues. BsSco is involved in the assembly of the Cu(A) center in cytochrome c oxidase and may play a role in the transfer of copper to this site. We have characterized the soluble domain of BsSco by biochemical, spectroscopic, and structural approaches. Soluble BsSco is monomeric in solution, and the two conserved cysteines are involved in an intramolecular cystine bridge. The cystine bridge is easily reduced, and circular dichroism spectroscopy shows no large-scale changes in BsSco's secondary structure upon reduction. The crystal structure of soluble BsSco, determined at 1.7 A resolution, reveals typical elements of a thioredoxin fold. The CXXXCP motif, in which Cys45 and Cys49 are conserved, is located in a turn structure on the surface of the protein. In various native and His135Ala mutant structures, both disulfide-bonded and non-disulfide-bonded forms of CXXXCP are observed. However, despite extensive attempts, copper has not been found near or beyond the CXXXCP motif, a presumptive copper-binding site. Another potential copper binding residue, His135, is located in a highly flexible loop parallel to the CXXXCP loop but is more than 10 A from Cys45 and Cys49. If these three residues are to coordinate copper, a conformational change is necessary. The structural identification of a disulfide switch demonstrates that BsSco has the capability to fill a redox role in Cu(A) assembly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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