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Enregistrement W2047733915 · doi:10.1186/1742-4690-10-s1-o28

Lv4, an activity that restricts nuclear entry of SIVMAC/SIVSM in human blood cells

2013· article· en· W2047733915 sur OpenAlexaff
Massimo Pizzato, Martha R. Neagu, Thomas Pertel, Claudia Firrito, Serena Ziglio, Madeleine Zufferey, Lionel Berthoux, Jeremy Luban

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyBiologySimian immunodeficiency virusInfectivityTransduction (biophysics)Viral entryPeripheral blood mononuclear cellVirusViral replicationGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SIVSM is a lentivirus endemic to the West African sooty mangabey (Cercocebus atys). HIV-2 and SIVMAC are zoonoses that resulted from SIVSM transmission to humans and Asian rhesus macaques (Macaca mulatto), respectively. Human leukemia cell lines, human peripheral blood mononuclear cells and CD4+ T cells, were 4 to 50-fold less permissive for SIVMAC and SIVSM than for HIV-1. In contrast, SIVMAC transduction of human adherent cell lines was equivalent to that of HIV-1. Consistent with adaptation to human cells, HIV-2 was not restricted as potently as was SIVMAC. SIVMAC transduction of human blood cells was rescued up to the level of HIV-1 by As2O3, a compound that increases the infectivity of viruses in the context of TRIM5-mediated restriction. Nonetheless, efficient knockdown of TRIM5 or cyclophilin A, a cytoplasmic factor that sometimes regulates TRIM5 restriction activity, did not rescue SIVMAC tranduction of these cells. Substitution of HIV-1 CA with the CA from SIVMAC rendered HIV-1 poorly infectious for Jurkat T cells. The block occurred after completion of reverse transcription and the formation of 2-LTR circles, but before establishment of the provirus. Heterokaryons resulting from fusion of permissive with restrictive cells exhibited the restrictive phenotype, indicating that SIV transduction of human blood cells is inefficient due to a dominant-acting restriction factor. These results demonstrate that the nucleus of human blood cells possesses a TRIM5-like restriction factor specific for the SIVMAC/SIVSM capsid and that, by extension, cross-species transmission of SIVSM to human cells necessitated adaptation of HIV-2 to this restriction factor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,441
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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