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Enregistrement W2047770011 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-3743

Abstract 3743: Effect of folic acid supplementation on epigenetics and cancer stem cell populations in established colorectal cancer cell lines.

2013· article· en· W2047770011 sur OpenAlexaff
Nathan Farias, Brenda L. Coomber

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA methylationCancer stem cellStem cellEpigeneticsBiologyCancer researchCancerMetastasisColorectal cancerProgenitor cellMethylationCell biologyBiochemistryGeneticsDNAGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mandated fortification of folic acid, a B vitamin involved in nucleotide synthesis and DNA CpG methylation, has led to a subsequent increase in blood folate concentration as well as a simultaneous increase in colorectal cancer incidence in North America. Recent findings suggest that a proportion of tumor cells, termed cancer stem cells (CSC), share properties with native stem cells and are vital in the development and perpetuation of tumor metastasis. Both epigenetic DNA modifications as well as the activation of established stem cell signaling pathways are responsible for the activation and maintenance of (CSC). CSC share properties with native stem cells and are vital in the development of primary lesions and the perpetuation of tumor metastasis. We hypothesize that folate, a CpG methylation altering agent, and extracellular microenvironment factors can influence the development and maintenance of CSCs. By isolating and characterizing the CSC fraction in established human colorectal cancer cell lines HCT116, Caco2, and SW480, LS174T and PC7, a subline of DLD-1, we have assessed the effect of folate on CSC signaling pathways and global DNA methylation. Cell lines were grown in suspension and supplemented with specialized stem cell media to promote the growth and expansion of the CSC fraction. Western blot analysis and immunofluorescence were used to characterize the protein expression and nuclear localization of proteins associated with established CSC maintenance pathways, respectively. Global DNA methylation status was assessed using an ELISA-based assay. HCT116 and SW480 show an increased ability to form colonospheres in culture compared to Caco2 and IEC18 (normal rat intestinal cell line). Cells grown in suspension show variable activation of stem cell renewal pathways compared to monolayer. Low folic acid levels led to reduced methylation status and colonosphere yield while high folic acid levels led to increased global methylation and an increased in colonosphere yield. Thus, altered folic acid exposure in vitro can influence the methylation status and CSC self-renewal ability of human colorectal cancer cells. The relationship between folic acid and cancer stem cell maintenance may be an important factor in the apparent duel modulatory effect of folic acid on colorectal cancer and warrants further investigation. Citation Format: Nathan Farias, Brenda Coomber. Effect of folic acid supplementation on epigenetics and cancer stem cell populations in established colorectal cancer cell lines. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 3743. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-3743

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,433
Écart entre enseignants0,355 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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