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Enregistrement W2047854979 · doi:10.1080/07060660809507493

Metabolite profiling coupled with statistical analyses for potential high-throughput screening of quantitative resistance to fusarium head blight in wheat

2008· article· en· W2047854979 sur OpenAlexaffvenue
H. Hamzehzarghani, V. Paranidharan, Y. Abu-Nada, Ajjamada C. Kushalappa, Yves Dion, S. Rioux, A. Comeau, Varoujan A. Yaylayan, William D. Marshall

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensCegep de Sainte FoyAgriculture and Agri-Food CanadaGrain Research CentreMcGill UniversitySte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusariumMetabolomicsBiologyMetaboliteCultivarGibberella zeaeMycotoxinVomitoxinBotanyHorticultureBiochemistryZearalenoneBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium head blight (FHB) [Fusarium graminearum (teleomorph Gibberella zeae)] causes considerable losses in wheat (Triticum aestivum) yield and grain quality. Because conventional screening for disease resistance based on five separate types of resistance is inefficient, a metabolomics approach to discriminating resistance was investigated. Spikelets of six wheat cultivars/lines varying in level of resistance were inoculated with F. graminearum or water. The spikelet disease severity was quantified, and the metabolic profiles were recorded using gas chromatography - mass spectrometry. A total of 214 metabolites were detected in spikelets and rachis, including 79 with acceptable treatment effects. Univariate analysis of variance identified 41 resistance-related (RR) metabolites and multivariate analysis identified 45 resistance function associated metabolites, including 28 RR metabolites. Highly resistant cultivar 'Wangshuibai' and line AW488 had the maximum numbers of constitutive (22) and induced (14) RR metabolites, respectively. A moderately resistant line, BRS177, had 12 induced RR metabolites. The RR metabolites identified here are potential candidate biomarkers for high-throughput screening of wheat breeding lines against FHB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,887
Score d'incertitude au seuil0,916

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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