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Enregistrement W2047942099 · doi:10.1016/j.yrtph.2014.05.018

OECD validation study to assess intra- and inter-laboratory reproducibility of the zebrafish embryo toxicity test for acute aquatic toxicity testing

2014· article· en· W2047942099 sur OpenAlexfundno aff
François Busquet, Ruben Strecker, Jane M. Rawlings, Scott E. Belanger, Thomas Braunbeck, Gregory J. Carr, Peter Cenijn, P. Fochtman, Anne Gourmelon, Nicole Hübler, André Kleensang, Melanie Knöbel, Carola Kussatz, Juliette Legler, Adam Lillicrap, Fernando Martı́nez-Jerónimo, Christian Polleichtner, Helena Rzodeczko, Edward R. Salinas, Katharina Schneider, Stefan Scholz, Evert‐Jan van den Brandhof, Leo T.M. van der Ven, Susanne Walter-Rohde, Stefan Weigt, Hilda Witters, Marlies Halder

Notice bibliographique

RevueRegulatory Toxicology and Pharmacology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental Toxicology and Ecotoxicology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUmweltbundesamtInstituto Politécnico NacionalDepartment for Environment, Food and Rural Affairs, UK GovernmentNewfoundland and LabradorEuropean Chemical Industry CouncilNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekHealth and Environmental Sciences Institute
Mots-clésToxicityReproducibilityAcute toxicityToxicologyZebrafishBiologyChemistryMedicineChromatographyInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The OECD validation study of the zebrafish embryo acute toxicity test (ZFET) for acute aquatic toxicity testing evaluated the ZFET reproducibility by testing 20 chemicals at 5 different concentrations in 3 independent runs in at least 3 laboratories. Stock solutions and test concentrations were analytically confirmed for 11 chemicals. Newly fertilised zebrafish eggs (20/concentration and control) were exposed for 96h to chemicals. Four apical endpoints were recorded daily as indicators of acute lethality: coagulation of the embryo, lack of somite formation, non-detachment of the tail bud from the yolk sac and lack of heartbeat. Results (LC50 values for 48/96h exposure) show that the ZFET is a robust method with a good intra- and inter-laboratory reproducibility (CV<30%) for most chemicals and laboratories. The reproducibility was lower (CV>30%) for some very toxic or volatile chemicals, and chemicals tested close to their limit of solubility. The ZFET is now available as OECD Test Guideline 236. Considering the high predictive capacity of the ZFET demonstrated by Belanger et al. (2013) in their retrospective analysis of acute fish toxicity and fish embryo acute toxicity data, the ZFET is ready to be considered for acute fish toxicity for regulatory purposes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,029
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,971
Score d'incertitude au seuil0,155

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0290,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations268
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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