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Enregistrement W2047946045 · doi:10.1128/jvi.00729-11

Virion Structure of Baboon Reovirus, a Fusogenic Orthoreovirus That Lacks an Adhesion Fiber

2011· article· en· W2047946045 sur OpenAlexafffund
Xiaodong Yan, Kristin N. Parent, Russell P. Goodman, Jinghua Tang, Jingyun Shou, Max L. Nibert, Roy Duncan, Timothy S. Baker

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Center for Research ResourcesCalifornia Department of Public HealthNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, San DiegoNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyReoviridaeCryo-electron microscopyGeneticsBiophysicsVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Baboon reovirus (BRV) is a member of the fusogenic subgroup of orthoreoviruses. Unlike most other members of its genus, BRV lacks S-segment coding sequences for the outer fiber protein that binds to cell surface receptors. It shares this lack with aquareoviruses, which constitute a related genus and are also fusogenic. We used electron cryomicroscopy and three-dimensional image reconstruction to determine the BRV virion structure at 9.0-Å resolution. The results show that BRV lacks a protruding fiber at its icosahedral 5-fold axes or elsewhere. The results also show that BRV is like nonfusogenic mammalian and fusogenic avian orthoreoviruses in having 150 copies of the core clamp protein, not 120 as in aquareoviruses. On the other hand, there are no hub-and-spoke complexes attributable to the outer shell protein in the P2 and P3 solvent channels of BRV, which makes BRV like fusogenic avian orthoreoviruses and aquareoviruses but unlike nonfusogenic mammalian orthoreoviruses. The outermost "flap" domains of the BRV core turret protein appear capable of conformational variability within the virion, a trait previously unseen among other ortho- and aquareoviruses. New cDNA sequence determinations for the BRV L1 and M2 genome segments, encoding the core turret and outer shell proteins, were helpful for interpreting the structural features of those proteins. Based on these findings, we conclude that the evolution of ortho- and aquareoviruses has included a series of discrete gains or losses of particular components, several of which cross taxonomic boundaries. Gain or loss of adhesion fibers is one of several common themes in double-stranded RNA virus evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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