Polymorphisms of mouse apolipoprotein A-11: seven alleles found among 41 inbred strains of mice
Notice bibliographique
Résumé
In mice, apolipoprotein A-II (apoA-II) associates to form amyloid fibrils in an age-associated manner. We determined the complete nucleotide sequences of the apoA-II gene (Apoa2) cDNA in 41 inbred strains of mice including Mus musculus domesticus (laboratory mouse), Mus musculus castaneus, Mus musculus molossinus, Mus musculus musculus and Mus spretus. Among these strains we identified 7 alleles (Apoa2a1, Apoa2a2, Apoa2b, Apoa2c, Apoa2d, Apoa2e and Apoa2f). Polymorphisms of nucleotides at 15 positions were detected and amino acid substitutions were found at 8 positions. Apoa2a1 was found in all mouse subspecies, but Apoa2b and Apoa2c were found only in Mus musculus domesticus. Two strains of Mus spretus have the unique alleles Apoa2e and Apoa2f which resemble Apoa2c. We confirmed that VICS in which we found severe amyloidosis here and other amyloidoneic strains in published reports have Apoa2c allele. We determined the plasma concentrations of total and HDL cholesterol in the strains of Mus musculus domesticus with the Apoa2a1, Apoa2b and Apoa2c alleles. Significantly higher concentrations of plasma cholesterol were observed in mouse strains with the Apoa2b allele. These findings provide fundamental data on mouse Apoa2 alleles. Furthermore, differences in these alleles likely have considerable influence on traits related to amyloidosis and lipid metabolism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».