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Enregistrement W2048027507 · doi:10.2135/cropsci2000.402518x

Development of PCR‐Based Markers for a High Grain Protein Content Gene from <i>Triticum turgidum</i> ssp. <i>dicoccoides</i> Transferred to Bread Wheat

2000· article· en· W2048027507 sur OpenAlexaff
Imtiaz Ahmed Khan, J. D. Procunier, D. G. Humphreys, G. Tranquilli, A. R. Schlatter, Susana N. Marcucci Poltri, R. C. Frohberg, Jorge Dubcovsky

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAmplified fragment length polymorphismTriticum turgidumLocus (genetics)GeneticsRestriction fragment length polymorphismQuantitative trait locusAlleleGenotypeGluteninGenetic markerCleaved amplified polymorphic sequenceGeneProtein subunitGenetic diversityPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Grain Protein Content (GPC) of wheat (Triticum aestivum L. and T. turgidum L.) is important for improved nutritional value and is also one of the major factors affecting breadmaking and pasta quality. A quantitative trait locus (QTL) for high GPC was detected a few years ago in the short arm of chromosome 6B from accession FA15‐3 of Triticum turgidum L. var. dicoccoides New molecular markers are presented here to facilitate the transfer of this high GPC gene into tetraploid and hexaploid wheat cultivars. Two sets of PCR (polymerase chain reaction) primers were designed to amplify regions of the non‐transcribed spacer of the XNor‐B2 locus. This locus was selected because it mapped on the peak of the QTL for GPC. The first pair of allele‐specific primers produced an amplification product only when the T. turgidum var. dicoccoides XNor‐B2 allele was present. The second pair of primers amplified fragment(s) of similar length in the different genotypes that after digestion with the restriction enzyme BamHI allowed differentiation of the T. turgidum var. dicoccoides allele. Four microsatellites markers were mapped on the short arm of chromosome 6B at both sides of the QTL peak and two on the long arm. Five additional amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers were mapped into the QTL region on 6BS. These PCR markers together with 10 restriction fragment length polymorphism (RFLP) markers showed that the hexaploid cultivar Glupro, selected for high GPC, carries a distal segment of chromosome 6BL and a proximal segment of 6BS from dicoccoides accession FA15‐3 encompassing the segment with highest LOD score for the GPC QTL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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