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Enregistrement W2048292202 · doi:10.1002/cbic.201402663

Synthesis and Analysis of Specific Covalent Inhibitors of <i>endo</i>‐Xyloglucanases

2015· article· en· W2048292202 sur OpenAlexafffund
Thomas Hauch Fenger, Harry Brumer

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBritish Columbia Knowledge Development FundNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésXyloglucanChemistryDisaccharideOligosaccharideGlycoside hydrolaseAffinitiesReagentGlycosideGlycanStereochemistryEnzymeCovalent bondBiochemistryAffinity labelActive siteMass spectrometryOrganic chemistryGlycoproteinChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A series of N-bromoacetylglycosylamines and bromoketone C-glycosides were synthesised from complex xyloglucan oligosaccharide (XyGO) scaffolds as specific active-site affinity labels for endo-xyloglucanases. Compounds based on XXXG (Xyl3 Glc4 ) and XLLG (Xyl3 Glc4 Gal2 ) oligosaccharides exhibited strikingly higher affinities and higher rates of irreversible inhibition than known cellobiosyl and new lactosyl disaccharide congeners when tested with endo-xyloglucanases from two distinct glycoside hydrolase (GH) families. Intact-protein mass spectrometry indicated that inactivation with XyGO derivatives generally resulted in a 1:1 labelling stoichiometry. Together, these results indicate that XyGO-based affinity reagents have significant potential as inhibitors and proteomic reagents for the identification and analysis of diverse xyloglucan-active enzymes in nature, to facilitate industrial enzyme applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,327

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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