PARP activation regulates the RNA-binding protein NONO in the DNA damage response to DNA double-strand breaks
Notice bibliographique
Résumé
After the generation of DNA double-strand breaks (DSBs), poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) is one of the first proteins to be recruited and activated through its binding to the free DNA ends. Upon activation, PARP-1 uses NAD+ to generate large amounts of poly(ADP-ribose) (PAR), which facilitates the recruitment of DNA repair factors. Here, we identify the RNA-binding protein NONO, a partner protein of SFPQ, as a novel PAR-binding protein. The protein motif being primarily responsible for PAR-binding is the RNA recognition motif 1 (RRM1), which is also crucial for RNA-binding, highlighting a competition between RNA and PAR as they share the same binding site. Strikingly, the in vivo recruitment of NONO to DNA damage sites completely depends on PAR, generated by activated PARP-1. Furthermore, we show that upon PAR-dependent recruitment, NONO stimulates nonhomologous end joining (NHEJ) and represses homologous recombination (HR) in vivo. Our results therefore place NONO after PARP activation in the context of DNA DSB repair pathway decision. Understanding the mechanism of action of proteins that act in the same pathway as PARP-1 is crucial to shed more light onto the effect of interference on PAR-mediated pathways with PARP inhibitors, which have already reached phase III clinical trials but are until date poorly understood.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».