Genomic and Metabolic Preparation of Muscle in Sockeye Salmon<i>Oncorhynchus nerka</i>for Spawning Migration
Notice bibliographique
Résumé
Prolonged endurance exercise and fasting are two major metabolic challenges facing Pacific salmon during spawning migrations that often occur over 1,000 km. Because both prolonged exercise and fasting stimulate the oxidation of lipids, particularly in heavily recruited tissues such as muscle, we sought to investigate the regulatory mechanisms that establish and maintain the capacity for substrate oxidation at four separate locations during the final 750 km of nonfeeding migration in sockeye salmon Oncorhynchus nerka. Transcript levels of multiple genes encoding for important regulators of lipid, carbohydrate, and protein oxidation as well as the activity of several important enzymes involved in lipid and carbohydrate oxidation were examined in red and white muscle. We found in both muscle types that the messenger RNA (mRNA) expression of carnitine palmitoyltransferase I isoforms, peroxisome proliferator-activated receptors α and β, and adenosine monophosphate-activated protein kinase β1 were all significantly higher at the onset compared to later stages of nonfeeding migration. However, the activities of β-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase and citrate synthase were higher only early in migration and only in red muscle. Later in the migration and as muscle lipid stores were greatly depleted, the mRNA levels of hexokinase I and aspartate aminotransferase increased in white muscle. Overall, at the onset of migration, high transcript and metabolic enzyme activity levels in skeletal muscle of sockeye salmon may help support the high rates of lipid oxidation needed for endurance swimming. Furthermore, we suggest that the muscle capacity to use carbohydrates and proteins may be adjusted throughout migration on an as-needed basis to fuel burst exercise through very difficult hydraulic passages in the river and perhaps during mating activities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».