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Enregistrement W2048534248 · doi:10.1139/g03-089

Genetic and physical mapping of homoeologous recombination points involving wheat chromosome 2B and rye chromosome 2R

2004· article· en· W2048534248 sur OpenAlexvenueno aff
Adam J. Lukaszewski, Krystyna Rybka, Viktor Korzun, С. В. Малышев, Bogusław Łapiński, Richard Whitkus

Notice bibliographique

RevueGenome · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRecombinationBiologyHomologous recombinationCentromereGeneticsHomologous chromosomeEctopic recombinationChromosomeGenetic recombinationChromosomal translocationChromosomal crossoverBreakpointMeiosisMitotic crossoverDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wide hybrids have been used in generating genetic maps of many plant species. In this study, genetic and physical mapping was performed on ph1b-induced recombinants of rye chromosome 2R in wheat (Triticum aestivum L.). All recombinants were single breakpoint translocations. Recombination 2RS-2BS was absent from the terminal and the pericentric regions and was distributed randomly along an intercalary segment covering approximately 65% of the arm's length. Such a distribution probably resulted from structural differences at the telomeres of 2RS and wheat 2BS arm that disrupted telomeric initiation of pairing. Recombination 2RL-2BL was confined to the terminal 25% of the arm's length. A genetic map of homoeologous recombination 2R-2B was generated using relative recombination frequencies and aligned with maps of chromosomes 2B and 2R based on homologous recombination. The alignment of the short arms showed a shift of homoeologous recombination toward the centromere. On the long arms, the distribution of homoeologous recombination was the same as that of homologous recombination in the distal halves of the maps, but the absence of multiple crossovers in homoeologous recombination eliminated the proximal half of the map. The results confirm that homoeologous recombination in wheat is based on single exchanges per arm, indicate that the distribution of these single homoeologous exchanges is similar to the distribution of the first (distal) crossovers in homologues, and suggest that successive crossovers in an arm generate specific portions of genetic maps. A difference in the distribution of recombination between the short and long arms indicates that the distal crossover localization in wheat is not dictated by a restricted distribution of DNA sequences capable of recombination but by the pattern of pairing initiation, and that can be affected by structural differences. Restriction of homoeologous recombination to single crossovers in the distal part of the genetic map complicates chromosome engineering efforts targeting genes in the proximal map regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,986
Score d'incertitude au seuil0,301

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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