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Enregistrement W2048598013 · doi:10.1158/0008-5472.can-09-2112

Fingerprint of Cell Metabolism in the Experimentally Observed Interstitial pH and pO2 in Solid Tumors

2009· article· en· W2048598013 sur OpenAlexafffund
Hamid R. Molavian, Mohammad Kohandel, Michael Milosevic, Sivabal Sivaloganathan

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensFields Institute for Research in Mathematical SciencesPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGlycolysisMetabolismIn vivoRespirationChemistryCancer cellCellular respirationCancerBiophysicsBiochemistryBiologyMitochondrion

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding cancer cell metabolism and targeting associated pathways is a field of increasing interest. Helmlinger and colleagues measured average pH and pO(2) as functions of distance from a single blood vessel on the micrometer scale. We show that these results provide unique insight into cancer cell metabolism in vivo when combined with an appropriate mathematical model. We calculate pH as a function of distance from a single blood vessel and for a given metabolism while incorporating a single CO(2) buffer with effective diffusion constants. By assuming that cancer cell metabolism is dominated by respiration with a smaller component of glycolysis in the normoxic state, by more balanced respiration and glycolysis in the hypoxic state, and by glycolysis alone in the anoxic state, we are able to semiquantitatively derive the experimental results of Helmlinger and colleagues. We also apply our model to glycolysis-impaired metabolism and show that the low pH and high pO(2) observed in these tumors may be related to the substantial shift from a respiration-dominated metabolism to one in which glutaminolysis dominates. Based on this, we propose an in vivo experimental measurement of pH in a glycolysis-impaired tumor to validate the modeling results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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