The impact of sequence divergence and DNA mismatch repair on homeologous recombination in Arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
We examined the effects of substrate divergence and DNA mismatch repair (MMR) on recombination in Arabidopsis thaliana. Relative to the frequency observed in plants with a homologous construct (0% divergence), recombination was decreased 4.1-, 9.6-, 11.7- or 20.3-fold, respectively, in lines with constructs containing 0.5%, 2%, 4% or 9% divergence between the recombination substrates. To evaluate the contribution of the MMR system in this decrease, 12 independent reporter lines (two or three lines per reporter construct) were crossed to an AtMSH2 T-DNA insertional mutant. We examined the recombination frequency in progeny homozygous for a reporter T-DNA and homozygous either for the wild type or the mutant allele of AtMSH2. The loss of MMR activity led to a two- to ninefold increase in homeologous recombination and the size of the increase did not seem to correlate with the amount of divergence. Inversely, complementation of the insertional mutant with a wild-type cDNA of AtMSH2 reduced recombination. Our results demonstrate clearly that sequence divergence can dramatically reduce the recombination frequency in plants and that the MMR system plays a part in this decrease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».