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Enregistrement W2048603086 · doi:10.1152/japplphysiol.00514.2007

A quantitative comparison of rates of phagocytosis and digestion of apoptotic cells by macrophages from normal (BALB/c) and diabetes-prone (NOD) mice

2007· article· en· W2048603086 sur OpenAlexaff
Athanasius F. M. Marée, Mitsuhiro Komba, Diane T. Finegood, Leah Edelstein‐Keshet

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Physiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhagocytosisNodApoptosisMacrophageDigestion (alchemy)NOD miceBALB/cBiologyIn vitroChemistryType 1 diabetesCell biologyMolecular biologyImmunologyDiabetes mellitusImmune systemBiochemistryEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrophages play an important role in clearing apoptotic debris from tissue. Defective or reduced clearance, seen, for instance, in non-obese diabetic (NOD) mice, has been correlated with initiation of autoimmune (Type 1) diabetes (T1D) (O'Brien BA, Huang Y, Geng X, Dutz JP, Finegood DT. Diabetes 51: 2481-2488, 2002). To validate such a link, it is essential to quantify the reduced clearance (for example, by comparison to BALB/c control mice) and to determine which elements of that clearance are impaired. Recently, we fit data for the time course of in vitro macrophage feeding experiments to basic models of macrophage clearance dynamics, thus quantifying kinetics of uptake and digestion of apoptotic cells in both mouse strains (Marée AFM, Komba M, Dyck C, Łabeçki M, Finegood DT, Edelstein-Keshet L. J Theor Biol 233: 533-551, 2005). In the cycle of modeling and experimental investigation, we identified the importance of 1) measuring short-, intermediate-, and long-time data (to increase the accuracy of parameter fits), and 2) designing experiments with distinct observable regimes, including engulfment-only and digestion-only phases. Here, we report on new results from experiments so designed. In comparing macrophages from the two strains, we find that NOD macrophage engulfment of apoptotic cells is 5.5 times slower than BALB/c controls. Significantly, our new data demonstrate that digestion is at least two times slower in NOD, in contrast with previous conclusions. Moreover, new data enable us to detect an acceleration in engulfment (after the first engulfment) in both strains, but much smaller in NOD macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,548

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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