Dimeric Structure of Human Na+/H+ Exchanger Isoform 1 Overproduced in Saccharomyces cerevisiae
Notice bibliographique
Résumé
The Na(+)/H(+) exchanger isoform 1 (NHE1) is an integral membrane protein that regulates intracellular pH by extruding an intracellular H(+) in exchange for one extracellular Na(+). The human NHE1 isoform is involved in heart disease and cell growth and proliferation. Although details of NHE1 regulation and transport are being revealed, there is little information available on the structure of the intact protein. In this report, we demonstrate overexpression, purification, and characterization of the human NHE1 (hNHE1) protein in Saccharomyces cerevisiae. Overproduction of the His-tagged protein followed by purification via nickel-nitrilotriacetic acid-agarose chromatography yielded 0.2 mg of pure protein/liter of cell culture. Reconstitution of hNHE1 in proteoliposomes demonstrated that the protein was active and responsive to an NHE1-specific inhibitor. Circular dichroism spectroscopy of purified hNHE1 revealed that the protein contains 41% alpha-helix, 23% beta-sheet, and 36% random coil. Size exclusion chromatography indicated that the protein-detergent micelle was in excess of 200 kDa, consistent with an hNHE1 dimer. Electron microscopy and single particle reconstruction of negatively stained hNHE1 confirmed that the protein was a dimer, with a compact globular domain assigned to the transmembrane region and an apical ridge assigned to the cytoplasmic domain. The transmembrane domain of the hNHE1 reconstruction was clearly dimeric, where each monomer had a size and shape consistent with the predicted 12 membrane-spanning segments for hNHE1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».