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Enregistrement W2048736081

Coding Regions of MSX1 Do Not Contribute to Non-Syndromic Cleft Lip With/Without Palate in Turkish Patients

2014· article· en· W2048736081 sur OpenAlexvenueno aff
Korkut Ulucan, Arzu Akçay, Burak Aksoy, Mehmet Boyraz, Deniz Kıraç, Deniz Ergeç, Necati Taşkın, Ozhan Ozcelebiler, Muhsin Konuk, Teoman Akçay, Ahmet İlter Güney

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Clinical Pediatrics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCleft Lip and Palate Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomeoboxCraniofacialTurkish populationTurkishGeneticsCoding regionGenotypingMedicineCohortGenePopulationBiologyInternal medicineGenotypeTranscription factor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: One of the candidate genes for non-syndromic cleft lip with/without palate (NS-CL/P) is muscle segment homeobox 1 ( MSX1 ) gene. MSX1 codes for a homeodomain protein that function as a transcriptional repressor during craniofacial development. In this study, we investigated the contribution of coding regions and exonic-intronic boundaries of MSX1 in Turkish NS-CL/P patients and the gender distribution of NS-CL/P in examined cohort. Methods: We analyzed a total of 100 NS-CL/P Turkish patients, of whom 61 were boy and, 100 non-affected children of whom 44 were boys. Genotyping procedure was assessed by polymerase chain reaction-sequencing protocol. Fisher Exact Analysis was performed to compare the gender difference. Results: We detected no variations in coding regions and intronic-exonic boundaries of MSX1 in both groups. Boys to girls ’ ratio were 1.6 in our patient group. There was a statistically significant gender difference between groups, boys were more effected than girls (P = 0.023). Conclusions: This was the first report including MSX1 in Turkish patients with NS-CL/P. We detected no sequence variations in the coding regions, including the exonic-intronic boundaries of MSX1 in our study population. More comprehensive analysis of MSX1 in Turkish population is required to fulfill MSX1 role for the onset of the anomaly. Int J Clin Pediatr. 2014;3(1):12-15 doi: http://dx.doi.org/10.14740/ijcp136e

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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