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Enregistrement W2048831569 · doi:10.18388/abp.2005_3451

Endoplasmic reticulum quality control and apoptosis.

2005· article· en· W2048831569 sur OpenAlexafffund
Jody Groenendyk, Marek Michalak

Notice bibliographique

RevueActa Biochimica Polonica · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Heritage Foundation for Medical Research
Mots-clésCalnexinCell biologyEndoplasmic reticulumUnfolded protein responseCalreticulinChaperone (clinical)ChemistryEndoplasmic-reticulum-associated protein degradationBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ER is one of the most important folding compartments within the cell, as well as an intracellular Ca(2+) storage organelle and it contains a number of Ca(2+) regulated molecular chaperones responsible for the proper folding of glycosylated as well as non-glycosylated proteins. The luminal environment of the ER contains Ca(2+) which is involved in regulating chaperones such as calnexin and calreticulin, as well as apoptotic proteins caspase-12 and Bap31, which may play an important role in determining cellular sensitivity to ER stress and apoptosis. The ER quality control system consists of several molecular chaperones, including calnexin, that assist in properly folding proteins and transporting them through the ER as well as sensing misfolded proteins, attempting to refold them and if this is not possible, targeting them for degradation. Accumulation of misfolded protein in the ER leads to activation of genes responsible for the expression of ER chaperones. The UPR mechanism involves transcriptional activation of chaperones by the membrane-localized transcription factor ATF6, in conjunction with the ER membrane kinase IRE1, as well as translational repression of protein synthesis by another ER membrane kinase PERK. When accumulation of misfolded protein becomes toxic, apoptosis is triggered, potentially with IRE1 involved in signaling via caspase-12. Both the extrinsic and intrinsic apoptotic pathways appear to culminate in the activation of caspases and this results in the recruitment of mitochondria in an essential amplifying manner. Bap31 may direct pro-apoptotic crosstalk between the ER and the mitochondria via Ca(2+) in conjunction with caspase-12 and calnexin. Accordingly, ER stress and the resultant Ca(2+) release must be very carefully regulated because of their effects in virtually all areas of cell function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,184
Score d'incertitude au seuil0,925

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations176
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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