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Enregistrement W2048853844 · doi:10.1093/carcin/bgm077

The functional genetic variant Arg324Gly of frizzled-related protein is associated with colorectal cancer risk

2007· article· en· W2048853844 sur OpenAlexaff
Kandavel Shanmugam, Hermann Brenner, Michael Hoffmeister, Jenny C. Chang, Barbara Burwinkel

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFrizzledWnt signaling pathwayColorectal cancerCarcinogenesisCancer researchCancerLRP6LRP5BiologyInternal medicineEndocrinologyMedicineSignal transductionOncologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Wnt-beta-catenin pathway plays a central role in colorectal tumorigenesis. Frizzled-related protein (FRZB, also termed secreted frizzled-related protein 3, sFRP3) antagonizes the signaling of wingless (Wnt) ligands through the frizzled membrane-bound receptors, resulting in beta-catenin destabilization thereby suppressing the expression of target genes. Recently, the FRZB Gly324 variant has been shown to have an attenuated ability to antagonize Wnt signaling and to be associated with an increased osteoarthritis risk. Here, we investigated, for the first time, the role of Arg324Gly (970C>G) along with Arg200Trp (598C>T) on colorectal cancer (CRC) risk by analyzing 659 patients and 607 control individuals drawn from the German DACHS (Darmkrebs: Chancen der Verhütung durch Screening) study. Although Arg200Trp showed no effect on CRC risk, we found homozygous carriers of Gly324 more frequent in cases than in controls, leading to a significantly increased risk for CRC [odds ratio (OR) = 5.1, 95% confidence interval (95% CI) = 1.74-14.71, P < 0.001]. The association was stronger in rectal cancer (OR = 7.52, 95% CI = 2.40-23.25, P < 0.0001) than in colon cancer (OR = 3.66, 95% CI = 1.14-11.76, P < 0.05). Since modified Wnt signaling and down-regulation of frizzled-related proteins have been observed in many human cancers, this variant may also affect the susceptibility to other cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,178
Score d'incertitude au seuil0,545

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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