Spontaneous mutation of the <i>lacI</i> transgene in rodents: Absence of species, strain, and insertion‐site influence
Notice bibliographique
Résumé
Comparison of spontaneous mutation spectra derived from different transgenic constructs can provide valuable insights for interpreting the mechanisms of spontaneous mutation. In this study, spontaneous mutation frequencies and spectra of the lacI transgene are compared in the liver of C57BL/6, B6C3F1, and BC-1 mice and F344 rats. Before correction for clonal expansion, the mutant frequency varied from 2.6 +/- 0.45 to 5.0 +/- 2.4 x 10(-5). Correction for potential clonal expansion reduced the range in mutation frequency to between 2.3 +/- 0.45 and 3.5 +/- 2.0 x 10(-5). There is thus no statistical difference in spontaneous mutation frequency between the different strains and species. G:C --> A:T transitions and to a lesser extent, G:C --> T:A transversions dominate the mutational spectra in all of these animals. In three strains of mice, G:C --> A:T transitions account for 50.7-53.3% of mutation, 81.7-83.8% of which involve CpG sites, whereas G:C --> T:A transversions account for 17.8-32.9% of mutations with 43.2-50.0% found at CpG sites. In rats, G:C --> A:T transitions account for 38.0% of the spectra, 70.0% of which involve CpG sites, whereas G:C --> T:A transversions account for 23.0% of the spectra, 70.0% of which involve CpG sites. The distribution of other classes of mutations is also very similar. We conclude that, despite reports about species and strain differences in induced mutation, spontaneous mutations in the lacI transgene appear to be similar, regardless of genomic location, rodent strain, or species. In addition to insights into spontaneous mutation, this study also provides essential data for comparison with and interpretation of induced mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».