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Enregistrement W2048953337 · doi:10.1111/j.1365-2443.2009.01320.x

Conserved aromatic and basic amino acid residues in the pore region of <i>Caenorhabditis elegans</i> spastin play critical roles in microtubule severing

2009· article· en· W2048953337 sur OpenAlexfundno aff
Yuka Matsushita‐Ishiodori, Kunitoshi Yamanaka, Hiroshi Hashimoto, Masatoshi Esaki, Teru Ogura

Notice bibliographique

RevueGenes to Cells · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCore Research for Evolutional Science and TechnologyInstitute of GeneticsJapan Science and Technology AgencyMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésMicrotubuleAAA proteinsRandom hexamerBiologyCaenorhabditis elegansCell biologyTubulinATPaseBiochemistryBiophysicsEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations of human spastin, an AAA (ATPases associated with diverse cellular activity) family protein, cause an autosomal dominant form of hereditary spastic paraplegia, which is characterized by weakness, spasticity and loss of the vibratory sense in the lower limbs. Recently, it has been reported that spastin displays microtubule-severing activity. We also previously reported that Caenorhabditis elegans spastin homologue SPAS-1 displays microtubule severing. However, the detailed molecular mechanism of microtubule severing remains unknown. Here, we describe that SPAS-1 forms a stable hexamer in a concentration-dependent manner and that ATPase activity of SPAS-1 is greatly stimulated by microtubules. Furthermore, MTBD (microtubule-binding domain) of SPAS-1 is essential for binding to microtubules. Taken these results together, we propose that MTBD of SPAS-1 plays a critical role in enrichment of SPAS-1 to microtubules, where SPAS-1 is concentrated and able to form a stable hexamer, subsequently its ATPase activity is stimulated. On the other hand, our mutational analyses revealed that the conserved aromatic and basic amino acid residues in the pore region are important for microtubule severing. We also detected the direct interaction of the extremely acidic C-terminal polypeptide of tubulin with SPAS-1. Consequently, we propose that the central pore residues are important for the recognition of substrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil0,551

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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