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Enregistrement W2048989142 · doi:10.1186/1471-2407-7-52

Silencing of the XAF1 gene by promoter hypermethylation in cancer cells and reactivation to TRAIL-sensitization by IFN-β

2007· article· en· W2048989142 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchRoyal SocietyRoyal Society of CanadaCHEO Research InstituteHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésDNA methylationBiologyMethylationGene silencingCpG siteCancer researchCarcinogenesisPromoterMolecular biologyBisulfite sequencingGene expressionCancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: XIAP-associated factor 1 (XAF1) is a putative tumor suppressor that exerts its proapoptotic effects through both caspase-dependent and -independent means. Loss of XAF1 expression through promoter methylation has been implicated in the process of tumorigenesis in a variety of cancers. In this report, we investigated the role of basal xaf1 promoter methylation in xaf1 expression and assessed the responsiveness of cancer cell lines to XAF1 induction by IFN-beta. METHODS: We used the conventional bisulfite DNA modification and sequencing method to determine the methylation status in the CpG sites of xaf1 promoter in glioblastoma (SF539, SF295), neuroblastoma (SK-N-AS) and cervical carcinoma (HeLa) cells. We analysed the status and incidence of basal xaf1 promoter methylation in xaf1 expression in non-treated cells as well as under a short or long exposure to IFN-beta. Stable XAF1 glioblastoma knock-down cell lines were established to characterize the direct implication of XAF1 in IFN-beta-mediated sensitization to TRAIL-induced cell death. RESULTS: We found a strong variability in xaf1 promoter methylation profile and responsiveness to IFN-beta across the four cancer cell lines studied. At the basal level, aberrant promoter methylation was linked to xaf1 gene silencing. After a short exposure, the IFN-beta-mediated reactivation of xaf1 gene expression was related to the degree of basal promoter methylation. However, in spite of continued promoter hypermethylation, we find that IFN-beta induced a transient xaf1 expression, that in turn, was followed by promoter demethylation upon a prolonged exposure. Importantly, we demonstrated for the first time that IFN-beta-mediated reactivation of endogenous XAF1 plays a critical role in TRAIL-induced cell death since XAF1 knock-down cell lines completely lost their IFN-beta-mediated TRAIL sensitivity. CONCLUSION: Together, these results suggest that promoter demethylation is not the sole factor determining xaf1 gene induction under IFN-beta treatment. Furthermore, our study provides evidence that XAF1 is a crucial interferon-stimulated gene (ISG) mediator of IFN-induced sensitization to TRAIL in cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,295

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle