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Enregistrement W2049005631 · doi:10.1152/physiolgenomics.00144.2011

Characterization of the longissimus lumborum transcriptome response to adding propionate to the diet of growing Angus beef steers

2012· article· en· W2049005631 sur OpenAlex
R.L. Baldwin, Robert W. Li, Congjun Li, Jennifer M. Thomson, B.J. Bequette

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésPropionateBiologyTranscriptomeLipid metabolismBeef cattleAnimal scienceMetabolismFatty acidFood scienceBiochemistryGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Development of management paradigms that enhance the rate of gain and qualitative characteristics of beef carcass development has the potential to impact production and nutrient use efficiency but also mitigate losses to the environment. We used eight Black Angus beef steers (272.5 ± 17.6 kg initial body wt) fed a forage-based pelleted diet alone (n = 4) or supplemented with sodium propionate included (n = 4) for 42 days. High-quality RNA was extracted from the longissimus lumborum and subjected to transcriptome sequencing using RNA-seq technology. Trimmed reads were aligned to the bovine reference genome (Btau4.0, release 63) and uniquely mapped reads from control and propionate treatment groups were subject to further analysis using edgeR. Candidates were filtered to account for multiple testing and differentially expressed genes (153 at a false discovery rate of <5%) were analyzed using Gene Ontology (GO) analysis (GOseq) to select terms where enrichment had occurred. Significant GO terms included regulation of cholesterol transport, regulation of sterol transport, and cellular modified amino acid metabolic process. Furthermore, the top four identified gene networks included lipid metabolism, small molecule biochemistry, carbohydrate metabolism, and molecular transport-related categories. Notably, changes in lipid metabolism specific genes reflect both increased oxidative and lipid synthetic capacities. Metabolism-related gene changes are reflective of expected enhancements in lean tissue accretion patterns exhibited in steers where high ruminal propionate relative to other short chain fatty acids is observed. Propionate feeding induced increased N retention in rapidly growing Angus cattle, and the observed alterations in LL tissue lipid metabolism-related gene networks are consistent with enhanced cell formation and function (protein synthesis, and lipogenic vs. lipolytic activities).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle