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Enregistrement W2049066334 · doi:10.1021/jf051263l

Structural Requirements of Angiotensin I-Converting Enzyme Inhibitory Peptides:  Quantitative Structure−Activity Relationship Study of Di- and Tripeptides

2006· article· en· W2049066334 sur OpenAlexaff
Rotimi E. Aluko, Shuryo Nakai

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural and Food Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Hydrolysis and Bioactive Peptides
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTripeptideChemistryEnzymeInhibitory postsynaptic potentialBiochemistryRenin–angiotensin systemAngiotensin-converting enzymeStereochemistryPeptideBiologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A database consisting of 168 dipeptides and 140 tripeptides was constructed from published literature to study the quantitative structure--activity relationships of angiotensin I-converting enzyme (ACE) inhibitory peptides. Two models were computed using partial least squares regression based on the three z-scores of 20 coded amino acids and further validated by cross-validation and permutation tests. The two-component model could explain 73.2% of the Y-variance (inhibitor concentration that reduced enzyme activity by 50%, IC50) with the predictive ability of 71.1% for dipeptides, while the single-component model could explain 47.1% of the Y-variance with the predictive ability of 43.3% for tripeptides. Amino acid residues with bulky side chains as well as hydrophobic side chains were preferred for dipeptides. For tripeptides, the most favorable residues for the carboxyl terminus were aromatic amino acids, while positively charged amino acids were preferred for the middle position, and hydrophobic amino acids were preferred for the amino terminus. According to the models, the IC50 values of seven new peptides with matchable primary sequences within pea protein, bovine milk protein, and soybean were predicted. The predicted peptides were synthesized, and their IC50 values were validated through laboratory determination of inhibition of ACE activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations553
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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