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Enregistrement W2049100455 · doi:10.1159/000132759

Genome comparison in the genus Mus: a study with B1, MIF (mouse interspersed fragment), centromeric, and Y-chromosomal repetitive sequences

2008· article· en· W2049100455 sur OpenAlexaff
Yasuhiko Nishioka

Notice bibliographique

RevueCytogenetics and Cell Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using four repetitive sequences, we compared DNAs isolated from Mus caroli, M. cookii, M. hortulanus, M. musculus, M. pahari, M. saxicola, and M. spretus. Except for B1, these probes showed species-specific hybridization patterns. Mouse interspersed fragment (MIF) sequences were present in all species examined, but those defined by the 1.3-kb EcoR1 band were fewer in M. pahari and M. saxicola than in the other species. The Y-chromosomal probe showed male-specific accumulation only in M. hortulanus, M. musculus, and M. spretus, which are known to be closely related. The genetic difference between M. spretus and the other two species (M. hortulanus and M. musculus) was clearly demonstrated by a M. musuclus centromeric sequence that hybridized strongly to M. hortulanus and M. musculus DNA but was underrepresented in the genome of M. spretus. These results may suggest the usefulness of these repetitive sequences in the classification of Mus species that display only subtle morphological differences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,266
Score d'incertitude au seuil0,761

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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