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Enregistrement W2049118898 · doi:10.2174/138620712800194468

A High Throughput Scintillation Proximity Imaging Assay for Protein Methyltransferases

2012· article· en· W2049118898 sur OpenAlexfundno aff
Glorymar Ibáñez, David Shum, Gil Blum, Bhavneet Bhinder, Constantin Radu, Christophe Antczak, Minkui Luo, Hakim Djaballah

Notice bibliographique

RevueCombinatorial Chemistry & High Throughput Screening · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesMarch of Dimes FoundationNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteUniversity of TorontoMemorial Sloan-Kettering Cancer Center
Mots-clésMethyltransferaseMethylationEpigeneticsHigh-throughput screeningSmall moleculeDecitabineChemistryComputational biologyBiochemistryBiologyDNA methylationDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein methyltransferases (PMTs) orchestrate epigenetic modifications through post-translational methylation of various protein substrates including histones. Since dysregulation of this process is widely implicated in many cancers, it is of pertinent interest to screen inhibitors of PMTs, as they offer novel target-based opportunities to discover small molecules with potential chemotherapeutic use. We have thus developed an enzymatic screening strategy, which can be adapted to scintillation proximity imaging assay (SPIA) format, to identify these inhibitors. We took advantage of S-adenosyl-L-[3H-methyl]-methionine availability and monitored the enzymatically catalyzed [3H]-methyl addition on lysine residues of biotinylated peptide substrates. The radiolabeled peptides were subsequently captured by streptavidin coated SPA imaging PS beads. We applied this strategy to four PMTs: SET7/9, SET8, SETD2, and EuHMTase1, and optimized assay conditions to achieve Z' values ranging from 0.48 to 0.91. The robust performance of this SPIA for the four PMTs was validated in a pilot screen of approximately 7,000 compounds. We identified 80 cumulative hits across the four targets. NF279, a suramin analogue, was found to specifically inhibit SET7/9 and SETD2 with IC50 values of 1.9 and 1.1 μM, respectively. Another identified compound, Merbromin, a topical antiseptic, was classified as a pan-active inhibitor of the four PMTs. These findings demonstrate that our proposed SPIA strategy is generic for multiple PMTs and can be successfully implemented to identify novel and specific inhibitors of PMTs. The specific PMT inhibitors may constitute a new class of anti-proliferative agents for potential therapeutic use.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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