A truncated cytoplasmic topoisomerase IIα in a drug-resistant lung cancer cell line is encoded by aTOP2A allele with a partial deletion of exon 34
Notice bibliographique
Résumé
To study the problem of acquired resistance to widely used anti-cancer drugs that target the 170 kDa topoisomerase IIalpha (topo IIalpha), a drug-resistant human small-cell lung cancer cell line, H209/VP, was selected in VP-16. H209/VP cells express reduced levels of the 170 kDa topo IIalpha that is localized normally in the nucleus and also express lower levels of a 160 kDa topo IIalpha-related protein that is located predominantly in the cytoplasm. Band depletion immunoblotting experiments suggest that the H209/VP nuclear 170 kDa topo IIalpha is able to form ternary complexes with DNA and VP-16 in intact cells, but the ability of the cytoplasmic 160 kDa protein to do so is greatly diminished. Sequence analysis of the 3; end of the H209/VP mutant topo IIalpha mRNA and the TOP2A gene indicates that the mRNA is missing 200 nt that corresponds to exon 34 because the partial loss of the minimal 3; splice-acceptor sequence at the beginning of exon 34 results in splicing of exon 33 to exon 35. The protein predicted to be encoded by this mutant mRNA does not contain the COOH-terminal 109 amino acids of the wild-type enzyme that we have demonstrated contain a strongly functional nuclear localization signal sequence. Consequently, our data explain both the size and the cytoplasmic localization of the H209/VP mutant topo IIalpha. The mutant TOP2A allele in H209/VP cells differs from those in previously characterized cell lines with cytoplasmic topo IIalpha and extends the number of types of resistance-associated deletions in this region to 4. These findings indicate that this region of the TOP2A gene may be a hot spot for mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».