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Enregistrement W2049272564 · doi:10.2350/08-05-0477.1

Expression of Insulin-Like Growth Factor Pathway Proteins in Rhabdomyosarcoma: IGF-2 Expression is Associated with Translocation-Negative Tumors

2008· article· en· W2049272564 sur OpenAlexaff
Shalini Makawita, Michael Ho, Adam D. Durbin, Paul S. Thorner, David Malkin, Gino R. Somers

Notice bibliographique

RevuePediatric and Developmental Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInsulin-like growth factor 2 receptorBiologyRhabdomyosarcomaInsulin-like growth factor 1 receptorImmunohistochemistryInsulin-like growth factor 2Chromosomal translocationGrowth factorInsulin-like growth factorCancer researchAlveolar rhabdomyosarcomaFusion geneGene expressionCell cultureReceptorMolecular biologyGenePathologySarcomaImmunologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent studies have shown a significant involvement of insulin-like growth factor (IGF) signaling components in the pathogenesis of rhabdomyosarcoma (RMS). Furthermore, there has been some evidence to indicate that differential expression of IGF pathway genes can distinguish RMS subtypes. The present study utilized immunohistochemistry to determine the expression patterns of IGF1, IGF2, IGF binding protein 2 (IGFBP2), IGF receptor 1 (IGF1R), and IGF receptor 2 (IGF2R) in 24 embryonal RMS (ERMS) and 8 alveolar RMS (ARMS). A majority of tumors were positive for IGF2, IGFBP2, IGF1R, and IGF2R and negative for IGF1 expression. However, only IGF2 showed a significant difference in expression between the ERMS and ARMS subtypes, with higher levels of expression in ERMS (P = 0.0003). Within the ARMS subtype, IGF2 positivity was limited to PAX/FKHR translocation-negative tumors. The staining pattern for all 5 proteins was diffuse cytoplasmic in the majority of tumors. Analysis of RMS cell lines by real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction for IGF2 expression revealed significantly higher mean expression levels in ERMS and translocation-negative ARMS cell lines when compared to translocation-positive ARMS cell lines (P = 0.0027). Stable introduction of PAX3/FKHR into an ERMS cell line also demonstrated a significant reduction in IGF2 expression. The results of this study show that expression of the IGF2 ligand is associated with translocation-negative tumors and may serve as a diagnostic aid in distinguishing RMS subtypes. Furthermore, the in vitro results are supportive of a role for the PAX3/FKHR fusion gene in the inhibition of IGF2 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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