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Enregistrement W2049295056 · doi:10.1186/1742-4690-6-s3-p264

P16-35. Specific CD4 responses to HIV-1 epitopes in exposed seronegative (ESN) versus infected commercial sex workers

2009· article· en· W2049295056 sur OpenAlexaff
MW Kiguoya, J Mwanjewe, Brendan K. Ball, K Makubo, Joshua Kimani, Keith R. Fowke

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueSex work and related issues
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeHuman immunodeficiency virus (HIV)MedicineVirologyAntibodySex workersImmunologyEnvironmental healthResearch methodologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A long standing study of low social economic status commercial sex workers in the Majengo cohort has demonstrated variable susceptibility to HIV-1 infection, where some of the highly exposed subjects remain persistently seronegative signifying resistance to HIV-1. There has been intense interest in understanding mechanisms responsible for this phenomenon. Current research has shown that MHC alleles play a significant role in the possible mechanisms of resistance. However, if both HIV infected and resistant individuals have HIV specific T helper responses, then there is a certain uniqueness that protects the latter group from contracting the disease. This study evaluated the protective immunity in the light of specific selective peptide recognition. We analyzed the cellular immune responses by invitro stimulation of PBMC's isolated from the subjects with specific HIV-1 peptide pools. The peptide pools were designed from the entire HIV-1 Clade A proteome giving 778 overlapping peptides grouped into 20 pools. Each pool had 40 peptides except pool 20 which had 18 peptides. The immune response was determined using 10 colour LSR II flow cytometry to measure INFγ production at day 3 and proliferation at day 6 from a total of 66 individuals of whom 33 were resistant, 20 negatives and 18 infected. The resistant group shows more IFNγ production and proliferation, especially in response to peptide pools 1, 12, 13 and 14 (Env, P24, P31 and P2P7P1, P6 P7, Protease and REV peptide pools). The difference was significant at 95% CI with a p value of 0.0001. There was no correlation between IFNγ production and proliferation indicating that chemoreceptor polymorphism is important. Future directions include adding the cytokines panel at day 3 to measure polyfunctional immune responses in addition to breaking down the individual peptide pools that showed unique responses to characterize the magnitude of HIV specific reactivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,253
Score d'incertitude au seuil0,865

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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