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Enregistrement W2049352744 · doi:10.1104/pp.102.010926

Expression of the Apyrase-Like <i>APY1</i> Genes in Roots of<i>Medicago truncatula</i> Is Induced Rapidly and Transiently by Stress and Not by <i>Sinorhizobium meliloti</i> or Nod Factors

2003· article· en· W2049352744 sur OpenAlexfundno aff
M. Teresa Navarro-Gochicoa, Sylvie Camut, Andréas Niebel, Julie V. Cullimore

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of California, DavisInstitut National de la Recherche AgronomiqueInstitute of GeneticsUniversität BielefeldEuropean Commission
Mots-clésMedicago truncatulaRhizobiaBiologySinorhizobium melilotiGeneSinorhizobiumArabidopsisMutantApyraseMedicagoGeneticsGene familyComplementary DNAGene expressionSymbiosisBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The model legume Medicago truncatula contains at least six apyrase-like genes, five of which (MtAPY1;1, MtAPY1;2, MtAPY1;3, MtAPY1;4, and MtAPY1;5) are members of a legume-specific family, whereas a single gene (MtAPY2) has closer homologs in Arabidopsis. Phylogenetic analysis has revealed that the proteins encoded by these two plant gene families are more similar to yeast (Saccharomyces cerevisiae) GDA1 and to two proteins encoded by newly described mammalian genes (ENP5 and 6) than they are to mammalian CD39- and CD39-like proteins. Northern analyses and analyses of the frequencies of expressed sequence tags (ESTs) in different cDNA libraries suggest that in roots, leaves, and flowers, the more highly expressed genes are MtAPY1;3/MtAPY2, MtAPY1;3/MtAPY1;5 and MtAPY1;2/MtAPY1;3 respectively. In roots, at least four of the MtAPY1 genes are induced transiently within 3 to 6 h by a stress response that seems to be ethylene independent because it occurs after treatment with an ethylene synthesis inhibitor and also in the skl ethylene-insensitive mutant. This response also occurs in roots of the following symbiotic mutants: dmi1, dmi2, dmi3, nsp, hcl, pdl, lin, and skl. No evidence was obtained for a rapid, transient, and specific induction of the MtAPY genes in roots in response to rhizobia or rhizobial lipochitooligosaccharidic Nod factors. Thus, our data suggest that the apyrase-like genes, which in several legumes have been implicated to play a role in the legume-rhizobia symbiosis (with some members being described as early nodulin genes), are not regulated symbiotically by rhizobia in M. truncatula.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,325

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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