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Enregistrement W2049412978 · doi:10.1139/v01-162

Interaction of human serum albumin with oxovanadium ions studied by FT-IR spectroscopy and gel and capillary electrophoresis

2001· article· en· W2049412978 sur OpenAlexfundvenueno aff
Marc Purcell, J. F. Neault, H. Malonga, Hisayuki Arakawa, H.A. Tajmir‐Riahi

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Interaction Studies and Fluorescence Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryCapillary electrophoresisHuman serum albuminAqueous solutionMetal ions in aqueous solutionInfrared spectroscopyMoleculeHistidineGel electrophoresisInorganic chemistryNuclear chemistryAmino acidMetalChromatographyBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Some oxovanadium compounds have shown potential to inhibit RNase activity, while at the same time not inhibiting DNase activity. Some vanadyl complexes also inhibit protein synthesis in rabbit reticulocytes, but induce activation of protein–tyrosine kinase. To gain an insight into the interaction of oxovanadium ions with proteins, the present study was designed to examine the bindings of VOSO4 and NaVO3 salts with human serum albumin (HSA) in aqueous solution at physiological pH with metal ion concentrations of 0.0001 to 1 mM and HSA (fatty acid free) concentration of 2% w/v. Gel and capillary electrophoresis (CE) and Fourier transform infrared (FT-IR) spectroscopic methods were used to determine the metal ion binding mode, association constant, and the secondary structure of the protein in the presence of the oxovanadium compounds. Gel electrophoresis results showed that a maximum of 20 vanadyl cations (VO2+) are bound per HSA molecule with strong (K1 = 7.0 × 107 M–1) and weak (K2 = 6.5 × 105 M–1) bindings. Similarly, capillary electrophoresis showed two major bindings for vanadyl cation with K1 = 1.2 × 108 M–1 and K2 = 8.5 × 105 M–1, whereas vanadate (VO–3) has only a weak binding affinity (K = 6.0 × 103 M–1) with HSA molecule. The VO–3 binds mainly to the lysine ε-amino NH+3 groups, while VO2+ binds possibly to the histidine nitrogen atom and the N-terminal of the α-amine residue. Infrared spectroscopic analysis showed metal ion binding results in major protein secondary structural changes from that of the α-helix (55.0 to 43–44%) to the β-sheet (22.0 to 23–26%), β-antiparallel (12.0 to 13–16%), and turn (11.0 to 17–18%), at high metal ion concentration. The observed spectral changes indicate a partial unfolding of the protein structure, in the presence of oxovanadium ions.Key words: oxovanadium, protein, binding mode, binding constant, secondary structure, electrophoresis, FT-IR spectroscopy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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