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Enregistrement W2049443318 · doi:10.1021/bi000597v

Photolabeling Identifies Position 172 of the Human AT<sub>1</sub> Receptor as a Ligand Contact Point:  Receptor-Bound Angiotensin II Adopts an Extended Structure

2000· article· en· W2049443318 sur OpenAlexaff
Antony A. Boucard, Brian C. Wilkes, Stéphane A. Laporte, Emanuel Escher, Gaétan Guillemette, Richard Leduc

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReceptorLigand (biochemistry)Position (finance)ChemistryBiophysicsPoint (geometry)StereochemistryBiochemistryBiologyMathematicsGeometryBusiness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An angiotensin II (AngII) peptidic analogue in which the third residue (valine) was substituted with the photoreactive p-benzoyl-L-phenylalanine (Bpa) was used to identify ligand-binding sites of the human AT(1) receptor. High-affinity binding of the analogue, (125)I-[Bpa(3)]AngII, to the AT(1) receptor heterologously expressed in COS-7 cells enabled us to efficiently photolabel the receptor. Chemical and enzymatic digestions of the (125)I-[Bpa(3)]AngII-AT(1) complex were performed, and receptor fragments were analyzed in order to define the region of the receptor with which the ligand interacts. Results show that CNBr hydrolysis of the photolabeled receptor gave a glycosylated fragment which, after PNGase-F digestion, migrated as a 11.4 kDa fragment, circumscribing the labeled domain between residues 143-243 of the AT(1) receptor. Digestion of the receptor-ligand complex with Endo Lys-C or trypsin followed by PNGase-F treatment yielded fragments of 7 and 4 kDa, defining the labeling site of (125)I-[Bpa(3)]AngII within residues 168-199 of the AT(1) receptor. Photolabeling of three mutant receptors in which selected residues adjacent to residue 168 were replaced by methionine within the 168-199 fragment (I172M, T175M, and I177M) followed by CNBr cleavage revealed that the bound photoligand (125)I-[Bpa(3)]AngII forms a covalent bond with the side chain of Met(172) of the second extracellular loop of the AT(1) receptor. These data coupled with previously obtained results enable us to propose a model whereby AngII adopts an extended beta-strand conformation when bound to the receptor and would orient itself within the binding domain by having its N-terminal portion interacting with the second extracellular loop and its C-terminus interacting with residues of the seventh transmembrane domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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