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Enregistrement W2049454440 · doi:10.1099/vir.0.056267-0

Characterization of protein–protein interaction domains within the baculovirus Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus late expression factor LEF-3

2013· article· en· W2049454440 sur OpenAlexafffund
Kelsey Downie, Gbolagade Adetola, Eric B. Carstens

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAutographa californicaBiologyPlasmidTransfectionMolecular biologyRecombinant DNABimolecular fluorescence complementationGeneDNACell biologyVirologyGeneticsSpodoptera

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autographa californica nucleopolyhedrovirus late expression factor 3 (LEF-3) is required for late viral gene expression probably through its numerous functions related to DNA replication, including nuclear localization of the virus helicase P143 and binding to ssDNA. LEF-3 appears to interact with itself as a homo-oligomer, although the details of this oligomeric structure are not yet known. To examine LEF-3-LEF-3 interactions, a bimolecular fluorescent protein complementation assay was used. Pairs of recombinant plasmids expressing full-length LEF-3 fused to one of two complementary fragments (V1 or V2) of a variant of yellow fluorescent protein named 'Venus' were constructed. Plasmids expressing fusions with complementary fragments of Venus were co-transfected into Sf21 cells and analysed by fluorescence microscopy. Co-transfected plasmids expressing full-length V1-LEF-3 and V2-LEF-3 showed positive fluorescence, confirming the formation of homo-oligomers. A series of truncated V1/V2-LEF-3 fusions was constructed and used to investigate interactions with one another as well as with full-length LEF-3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,541

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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