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Enregistrement W2049522755 · doi:10.1074/jbc.m809023200

TIF1β/KAP-1 Is a Coactivator of the Orphan Nuclear Receptor NGFI-B/Nur77

2009· article· en· W2049522755 sur OpenAlexaff
Juliette Rambaud, Julien Desroches, Aurélio Balsalobre, Jacques Drouin

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCoactivatorNuclear receptor coactivator 3Nuclear receptor coactivator 1Nuclear receptorNerve growth factor IBNuclear receptor coactivator 2Transcription factorChromatin remodelingMediatorCancer researchOrphan receptorCorepressorHistone deacetylaseCell biologyNuclear receptor co-repressor 1BiologyMolecular biologyChemistryGeneticsHistone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In efforts to define mechanisms of transcriptional activation by the orphan nuclear receptor NGFI-B (Nur77), we identified TIF1beta by mass spectrometry within a nuclear protein complex containing NGFI-B. TIF1beta, also known as KAP-1 (KRAB domain-associated protein) or KRIP-1, acts as a transcriptional corepressor for many transcription factors, in particular for the Krüppel-associated box domain-containing zinc finger transcription factors. TIF1beta is also an intrinsic component of two chromatin remodeling and histone deacetylase complexes, the N-CoR1 and nucleosome remodeling and deacetylation complexes. In contrast to these activities, we report that TIF1beta is a coactivator of NGFI-B and that it is as potent as the SRC coactivators in this context. Using pull-down assays and immunoprecipitation, we showed that TIF1beta interacts directly with NGFI-B and with other Nur family members. NGFI-B is an important mediator of hypothalamic corticotropin-releasing hormone (CRH) activation of proopiomelanocortin (POMC) transcription, and TIF1beta enhances transcription mediated through the NGFI-B target, the Nur response element (NurRE). The NurRE binds Nur factor dimers and is responsive to signaling pathways. In keeping with the role of NGFI-B as mediator of CRH signaling, we found that TIF1beta is recruited to the POMC promoter following CRH stimulation and that TIF1beta potentiates CRH and protein kinase A signaling through the NurRE; it acts synergistically with the SRC2 coactivator. However, the actions of TIF1beta and SRC2 were mapped to different NGFI-B AF-1 subdomains. Taken together, these results indicate that TIF1beta is an important coactivator of NGFI-B-dependent transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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