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p53 protein accumulation and mutations in normal and benign breast tissue

2000· article· en· W2049560881 sur OpenAlexaff
Rita A. Kandel, Shu-Qiu Li, Hilmi Özçelik, Tom Rohan

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMissense mutationPathogenesisBiologyPathologyImmunohistochemistrySingle-strand conformation polymorphismMutationGeneGene mutationCarcinogenesisCancerCancer researchGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the p53 gene are amongst the most common molecular changes detected in breast cancer, and there are several reports suggesting that changes in p53 may contribute to the pathogenesis of this disease. In a previous case-control study, we demonstrated that p53 protein accumulation detected by immunohistochemistry in normal or benign breast tissue was associated with a 2.5-fold increase in the risk of subsequent breast cancer. In this study, we investigated whether p53 gene mutations were present in the 29 p53 immunopositive normal or benign breast tissue samples and in 15 p53 immunonegative normal or benign breast tissue samples selected randomly from the original study. DNA was extracted from paraffin sections and underwent PCR-SSCP analysis for exons 4 to 10. PCR products that showed abnormal mobility were excised and sequenced. Sixteen (59.2%) of the 27 immunopositive breast tissue samples and 4 (26.7%) of the 15 immunonegative samples had p53 sequence changes. There was no obvious association between the occurrence of these alterations and any specific histopathologic features. Ten cases showed p53 mutations, and they were all missense base substitutions of the transition type. Thirteen other gene changes occurred in 11 breast tissue samples and consisted of 8 silent (no amino acid change), 4 intronic alterations, and 1 indeterminate alteration. One individual had both a mutation and a silent change. In summary, p53 gene alterations can occur in normal or benign breast tissue, but resolution of their role in the pathogenesis of breast cancer will require long-term follow-up studies involving comparisons of breast cancer occurrence in patients with and without p53 mutations as well as functional assays to determine their significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,895
Score d'incertitude au seuil0,678

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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