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Enregistrement W2049576908 · doi:10.1186/1710-1492-6-s2-p23

Expression of Semaphorin4C by Th2-stimulated B cells

2010· article· en· W2049576908 sur OpenAlexaffvenue
Jean‐Philippe Drolet, J. Guay, Yasaman Nouhi, Bruce Mazer

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensMcGill UniversityChristie (Canada)McGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExpression (computer science)BiologyCell biologyMolecular biologyComputer scienceProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Semaphorins are a family of proteins implicated in neurogenesis, angiogenesis and axonal migration. Previous work from our laboratory has shown that Th2stimulated B cells express a unique semaphorin, SEMA4C. Given the roles of other semaphorins, we hypothesized that SEMA4C was expressed on Th2stimulated B cells and might play a role in B cell trafficking and tissue homing therefore being expressed stronger in terminally differentiated B cells, such as memory and plasma cells. Experiment and results B cells were purified from tonsils removed from children undergoing routine tonsillectomy. They were cultured for 24 hours or 7 days at a concentration of 5X10 4 cells/mL in complete medium in the presence of aCD40 with either IFNg, IL-4, IL-21 or both IL-4 and IL-21. RNA was extracted, cDNA was made, and SEMA4C mRNA was amplified by qPCR and compared to the housekeeping gene GAPDH. After 24h culture, SEMA4C mRNA expression was detected only in IL-4stimulated cells but after 7 days, the expression was much stronger in both conditions containing IL-21, and decreased in IL-4-only stimulated cells. B cells were also similarly cultured for 72 hours at a concentration of 0.5X10 6 cells/mL in chamber slides. Slides were stained for SEMA4C with a fluorescent Alexa488 antibody and then visualized using fluorescent microscopy. As expected, stimulation with IL-21 yielded much higher SEMA4C expression than IL-4 alone whereas IFNg did not induce significant staining. Figures 1 and 2. Conclusion SEMA4C is induced in B cells upon Th2 stimulation but increases further upon follicle-like differentiation triggered by IL-21. This data confirms that SEMA4C is specific to terminally-differentiated B cells and supports our hypothesis that it might play a role in B-cell trafficking and homing in peripheral tissue follicles. SEMA4C could therefore be a key player in local allergic inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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