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Enregistrement W2049741091 · doi:10.1158/1535-7163.targ-13-b20

Abstract B20: Defining the minimal ING1b-derived peptide that is pro-apoptotic.

2013· article· en· W2049741091 sur OpenAlexaff
Oleksandr Boyko, Karl Riabowol

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApoptosisBiologyCancer researchCancer cellCarcinogenesisCancerCell biologyMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Inhibitor of Growth 1b (ING1b) is a type II tumor suppressor and a core member of HDAC-containing chromatin-modifying complexes. ING1b contributes to regulation of gene expression, DNA damage repair and stress signalling, cell growth and senescence, tumorigenesis and apoptosis. Mislocalization of ING1b and decreased levels of ING1b are commonly found in human tumors and cancer cell lines, suggesting the possibility of using ING1b levels as a prognostic marker in clinics. Consistent with a pro-apoptotic function, ING1b protein positively regulates p21 and bax gene expression, and ING1b overexpression promotes apoptosis in p53-dependent and p53-independent manners. The inactivation of apoptosis pathways that is frequently observed in cancer cells causes a dramatic decrease in the efficiency of many cancer treatments. The inactivation of ING1b and suppression of apoptosis in tumors and a greater sensitivity of cancer vs. normal cells to elevated levels of ING1b suggest that modulation of ING1b expression in tumors may serve as a viable approach for cancer therapy. In this study we aim to expand our understanding of the molecular mechanism(s) by which ING1b promotes apoptosis in cancer cells. Consistent with a wide range of ING1b molecular functions, the protein displays a complex multidomain architecture. Here we define ING1b regions that are necessary for its apoptotic function to design minimal recombinant peptides with potent apoptosis-inducing properties. We previously noted that overexpression of a peptide containing multiple copies of the highly conserved Lamin Interacting Domain (LID) could induce apoptosis in a rapid and efficient way in several cancer cell line models. Here we report that peptides containing the third alpha helix (A3H) and NLS/NTS domains of the ING1b protein are able to induce apoptosis at levels comparable with those seen for full length ING1b protein. While the A3H region is necessary but not sufficient, the NLS domain is required, and partially sufficient, for induction of apoptosis. Cells overexpressing full length ING1b protein or the A3H-NLS peptide show similar changes in cell morphology characteristic of apoptosis, exhibit increased levels of PARP cleavage, and display similar levels of apoptosis as determined by FACS analysis using an Annexin V assay. Our ongoing studies will identify binding partners of the A3H-NLS peptide using mass spectrometry, and determine if the observed pro-apoptotic function of the A3H-NLS peptide requires the presence of these partners. Future experiments will assess the efficacy and specificity of the minimal peptide for controlling cancer cell growth and progression in cell lines and mouse breast cancer models via adenoviral delivery. Our long-term goal is to better define apoptosis pathways and to develop ING1b-based therapeutics for the selective induction of apoptosis in cancer cells. Citation Information: Mol Cancer Ther 2013;12(11 Suppl):B20. Citation Format: Oleksandr Boyko, Karl Riabowol. Defining the minimal ING1b-derived peptide that is pro-apoptotic. [abstract]. In: Proceedings of the AACR-NCI-EORTC International Conference: Molecular Targets and Cancer Therapeutics; 2013 Oct 19-23; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2013;12(11 Suppl):Abstract nr B20.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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